Η Αποκεντρωμένη Διοίκηση Ηπείρου – Δυτικής Μακεδονίας δραστηριοποιείται σε ποικίλα συγχρηματοδοτούμενα από ευρωπαϊκούς πόρους Προγράμματα/Έργα:
- Προγράμματα Ευρωπαϊκής Εδαφικής Συνεργασίας: Interreg
- Προγράμματα με συγχρηματοδότηση από την Ευρωπαϊκή Επιτροπή: LIFE, LIFE+, H2020
- Περιφερειακά Επιχειρησιακά Προγράμματα (Π.Ε.Π.) στις χωρικές ενότητες της Ηπείρου και της Δυτικής Μακεδονίας
- Τομεακά Επιχειρησιακά Προγράμματα (Τ.Ε.Π.)
- Πρόγραμμα Αγροτικής Ανάπτυξης
Η Αποκεντρωμένη Διοίκηση Ηπείρου – Δυτικής Μακεδονίας ανταποκρίνεται σε προσκλήσεις συμμετοχής σε Προγράμματα / Έργα είτε πρόκειται για στοχευμένες είτε για ανοικτές προσκλήσεις σε δυνητικούς δικαιούχους και συμμετέχει ως μοναδικός δικαιούχος ή συν-δικαιούχος τόσο σε πολυμερή / πολυεθνικά σχήματα (Interreg, LIFE,H2020) όσο και σε εθνικά επιχειρησιακά προγράμματα (Π.Ε.Π, Τ.Ε.Π.).
Συμμετέχει σε έργα με στρατηγικό χαρακτήρα, όπως τα Εθνικά Σχέδια Διαχείρισης για την εφαρμογή των Κοινοτικών Οδηγιών 2000/60/ΕΚ για τα Ύδατα και 2007/60/ΕΚ για τις Πλημμύρες.
Παράλληλα, ο Φορέας είναι σταθερά προσανατολισμένος στην συμμετοχή του σε έργα στον τομέα της Ευρωπαϊκής Εδαφικής Συνεργασίας με γείτονες χώρες, καθώς εκ της χωρικής του αρμοδιότητας εκτείνεται γεωγραφικά σε δώδεκα νομούς καλύπτοντας ένα μεγάλο εύρος της διασυνοριακής γραμμής.